Студенты и молодые преподаватели нашего института ушли на фронт защищать Родину, и многие из них не вернулись. В борьбе с врагом погибли смертью храбрых — завкафедрой марксизма-ленинизма доценты М. Л. Нудьга, И. С. Кузнецов, ассистенты М. Г. Мороз-Морозенко, Е. И. Константинов, аспирант Н. П. Ходоков и многие другие.
С первых дней войны коллектив института включился в оборонительные работы. Ряд кафедр института перестраивает тематику своих исследований, включая в разработку вопросы, имеющие оборонное значение, а также принимает участие в непосредственной поддержке фронта. Так, профессор Ждан-Пушкин организует производство боеприпасов с привлечением сотрудников и студентов института, профессорами Плисовым, Парфентьевым и Смирновым организуется изготовление медицинских препаратов — камфорного масла, сульфидина, стрептоцида, сульфазола и пенициллина. Профессорско-преподавательский состав агрономических кафедр включается в помощь колхозам и совхозам (читают лекции, публикуют брошюры, статьи). Профессор П. Э. Стребейко изобретает аппарат для капельного переливания крови.
Государственным признанием значимости работы КИВИВ (что это?) стало награждение его профессора Антона Михайловича Фролова-Багреева высшим советским отличием для творческого работника — Сталинской премией. 11 апреля 1942 года газета «Известия Советов депутатов трудящихся СССР» опубликовала Постановление Совета народных комиссаров «О присуждении Сталинской премий за: а) выдающиеся изобретения и б) коренные усовершенствования методов производственной работы» — от 10 апреля 1942 года, подписанное председателем Совнаркома И. В. Сталиным. В постановлении наряду с изобретателями грозного оружия И. В. Курчатовым, С. В. Илюшиным, А. С. Яковлевым и другими в списке лауреатов Сталинской премии под № 26 значилась фамилия краснодарского винодела А. М. Фролова-Багреева.
Этим же постановлением звание лауреата Сталинской премии было присвоено академику Александру Александровичу Шмуку.
Летом 1942 года гитлеровским полчищам удалось прорваться на Северный Кавказ. Советские войска были вынуждены временно отступить. В этих условиях правительство приняло решение вывезти из Краснодара наиболее ценные для народного хозяйства институты: химико-технологический, виноделия и виноградарства, медицинский.
Эвакуация началась 2 августа 1942 года, в день установленный Наркоматом. К этому периоду в КИВИВ осталось всего 44 преподавателя и 80 студентов. Из воспоминаний бывшей студентки, позднее — старшего инженера кафедры технологии табака А. Д. Зеленской.
Студенты и большинство преподавателей двинулись пешком. Транспорт был представлен 8 лошадьми, из них 5 племенных жеребцов. По дороге лошадей забрали для нужд армейских частей, а две из них позднее были переданы Адлерскому хлебокомбинату. Была и одна машина. В колонне института шли профессора Е. С. Блажний А. Ф. Бучинский, П.С Ерыгин, И. С. Косенко, доценты Асмаеав П.Г., В. К. Зоз, А. А. Мерджаниан, Л. Н. Флоренова, А. А. Самоделов, ассистент Н. И. Володарский, главный бухгалтер Н. С. Мохов и др.
8 августа по дороге через Туапсе на Сочи были вывезены профессора старшего поколения с семьями — Г. Г. Агабальянц, М. П. Архангельский, доцент В. М. Лоза. С собой люди взяли самые необходимые вещи, архив и документацию института. У станицы Хадыженской обоз попал под жестокую бомбежку, во время которой были ранены бухгалтер Н. С. Мохов и несколько студентов.
Вскоре был образован штаб, в который вошли П. Г. Асмаев, И. С. Косенко, Л. И. Флоренова, Ю. Н. Лушников и др. С этого момента институтом руководил П. Г. Асмаев.
Колона института двинулась дальше. Теперь при движении колонну сопровождали постоянные налеты и бомбежки, т. к. двигались по дороге, по которой отступали наши войска. Старались идти ночами, а в светлое время суток скрывались в лесу. Самым тяжелым участком стал Туапсинский перевал, который удалось преодолеть чудом. Далее путь пролегал через станцию Лазаревскую и Сочи в Адлер, где сотрудники и студенты были приняты в своем доме профессором Н. А. Тхагушевым.
Благодаря ректору Асмаеву в Адлере были выделены автобусы, и всех переправили в Сухуми. Здесь в Ботаническом саду встретились две группы коллектива: шедшие пешком и приехавшие ранее. Далее следовали вместе. В Сухуми институту было предложено выехать в Тбилиси, а затем в Ереван.
В Ереване студентов виноделов под руководством В. М. Лозы разместили в совхозе винодельческого треста. Остальные продолжили путь в Баку.
К этому времени люди представляли собой жалкое зрелище: измученные, оборванные, голодные, завшивленные, они держались с трудом. Особенно трепала малярия. Но трудности сплачивали и роднили. Каждый думал не только о себе, но и о идущих рядом. Студентка З. Еременко несла в вещевом мешке годовалую дочь. Она отстала, и когда догнала своих, в ребенке еле теплилась жизнь. Девочку отходили жены преподавателей.
В Баку обоз никто не ждал. Люди разместились под открытым небом на пристани № 16, где 10 дней ожидали переправы через Каспий. В Баку Асмаева пригласили в Наркомат, где формально назначили ректором. Во многом благодаря инициативе, находчивости и мудрости П. Г. Асмаева, институт преодолел трудности и сохранил свое лицо.
Жизнь в Самарканде была трудной. Чтобы поддержать жизненные силы, студенты работали на виноградниках. Профессора совмещали работу в институте с работой в других учебных заведениях. Мучили голод и неустройство.
Но вот 12 февраля 1943 года по радио сообщили об освобождении Краснодара. Это был настоящий праздник. Все стали собираться домой, но до отъезда было еще много времени.
По возвращении в Краснодар узнали, что здание института занято госпиталем, временно институт разместили в школе № 28. Люди, вернувшиеся из эвакуации, были настолько жалкими, оборванными, что ректор обратился с просьбой о помощи к члену Государственного комитета обороны и бюро Совнаркома СССР тов. А. И. Микояну. По его распоряжению институт получил вагон одежды и обуви. Городскими властями преподаватели и студенты были прикреплены к столовым. И все приступили к восстановлению разрушенного оккупантами родного института. 17 сентября 1943 года директором института был назначен Асмаев.
Фашистские вандалы, вторгшиеся на Кубань, варварски уничтожили ценнейшее оборудование Краснодарского института виноградарства и виноделия, собранное в течение многих лет. Были сожжены основные учебные здания, общежития и до 80% оборудования. Ущерб, нанесенный институту фашистскими варварами, исчислялся 20 миллионами рублей.
Ветераны нашего университета сражались на фронтах Великой Отечественной войны, некоторые из них трудятся и сегодня.
В рядах морской пехоты — «черной смерти», как ее называли гитлеровцы, сражался Яков Васильевич Губанов.
На подводной лодке «С-101», которая в годы Великой Отечественной войны воевала в составе Северного флота, группой радистов и акустиков руководил Александр Трофимович Ювков. «Глаза и уши корабля», — так образно называли его друзья.
Героический экипаж этой подводной лодки за годы войны потопил шесть транспортов противника водоизмещением пятьдесят тысяч тонн, два эсминца, два тральщика, подводную лодку и сторожевой корабль.
В 1972 г. в СССР в прокат вышел фильм «Командир счастливой щуки». В основу его сценария был положен боевой путь Краснознаменной лодки.
Обороняли Сталинград Р. Б. Александров, Е. В. Тонконоженко.
Защищали Ленинград В. А. Скляр, В. П. Горячева — она молодой девушкой работала в госпитале медсестрой.
18-летним пареньком ушел на фронт Петр Васильевич Сидневец. Он был разведчиком в дивизионной разведке. Перенес два тяжелых ранения, тяжелую контузию. Был заживо похоронен, дважды родителям приходили похоронки…
О каждом участнике можно писать книги, снимать фильмы. У каждого своя тяжелая война.